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Plateforme d'analyse moléculaires "Biodiversité - environnement"
La plate-forme axe son activité sur l’analyse de la biodiversité microbienne dans tout type de matrices environnementales (eau, sol) et pouvant être élargie à l’agroalimentaire. Ces analyses sont réalisées par des approches classiques de microbiologie et par des techniques moléculaires spécifiques pour l’analyse de la biodiversité microbienne : empreintes moléculaires 16S et 18S (TTGE, qPCR, MiSeq Illumina©).
Moyens techniques dont dispose la plateforme :
- Petits matériels : ensemble du petit matériel de laboratoire nécessaire aux manipulations de microbiologie
- Équipement semi-lourd : congélateurs et réfrigérateurs, bains thermostatés, agitateurs, centrifugeuses, 1 thermocycleur Biorad CFX96 (PCR et qPCR), dCODE système (fingerprinting, PCR-TGGE et DGGE), système d’acquisition d’image Gel Doc XR+, logiciels d’analyse bio-informatique FpQuest, fluorimètre, PSM
La plateforme d’analyse travaille en partenariat avec des laboratoires universitaires de Nantes et Angers et peut accéder à de nombreux autres matériels de recherche (dont MEB, phytotron, ICP-MS, ICP-OES pour le dosage des métaux).